Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms