Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 451.3 ms