Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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