Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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