Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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RFXAPO00287 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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RFXAPO00287 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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RFXAPO00287 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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RFXAPO00287 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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