Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL133230.1-201ENST00000431019 4587 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC241585.4-201ENST00000640951 686 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TMEM52B-203ENST00000381923 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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