Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 LINC00662-203ENST00000586954 2254 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 THNSL1-202ENST00000524413 3788 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 2102 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 CNDP1-203ENST00000582365 4111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 TP63-204ENST00000392460 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 CEACAM5-208ENST00000615021 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 RAD9B-207ENST00000409778 1373 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 RPS27-202ENST00000392558 625 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC020687.1-201ENST00000560439 448 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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C4orf17Q53FE4 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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C4orf17Q53FE4 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AL583836.1-201ENST00000464755 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 TCF4-226ENST00000565018 2357 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 NECAP1-210ENST00000638237 2517 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 SEPT4-211ENST00000579371 1362 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 NXPE3-207ENST00000616286 1832 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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