Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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