Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms