Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 HERC3-202ENST00000402738 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KALRN-201ENST00000240874 6537 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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