Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 CD300LF-208ENST00000581500 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AP001178.3-201ENST00000585150 2106 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 TRAF6P1-201ENST00000429404 1558 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 PRDM10-205ENST00000526082 3308 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 ABCG1-204ENST00000398437 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 NUTM1-202ENST00000438749 3922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 SCARA3-201ENST00000301904 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 SLC12A1-203ENST00000396577 4708 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 DCN-220ENST00000552962 1930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 BROX-208ENST00000539697 3734 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRHP20396 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 ANKRD55-203ENST00000504958 2139 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 SWT1-201ENST00000367500 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 ABCB1-211ENST00000622132 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC113189.6-201ENST00000636696 3591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 DENND2A-208ENST00000492720 3614 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TRHP20396 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TRHP20396 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TRHP20396 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TRHP20396 LINC01438-201ENST00000512794 556 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TRHP20396 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC011195.2-201ENST00000583666 1486 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNF38-206ENST00000377885 4985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 CYP2C9-201ENST00000260682 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 C8orf44-201ENST00000390159 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRHP20396 CHRNA6-205ENST00000534622 1872 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 MROH7-203ENST00000395690 3413 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 RASSF2-201ENST00000379376 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 LINC00943-203ENST00000535544 2815 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 INTS3-210ENST00000512605 3442 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 MED28P1-201ENST00000399158 571 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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