Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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