Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TRIM51-202ENST00000449290 1629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 DCAF4-212ENST00000553457 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 BAAT-202ENST00000395051 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 DLGAP1-AS2-201ENST00000572856 2261 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC100771.2-201ENST00000525833 1350 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ZNF189-204ENST00000615466 2316 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC093904.4-201ENST00000565044 3273 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 MTO1-201ENST00000370300 2961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 EXOC7P1-201ENST00000509881 2059 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 GLRA1-201ENST00000274576 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ABCC11-204ENST00000394748 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PCDHGA5-202ENST00000611914 3552 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC116456.2-201ENST00000623018 2209 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 MKL2-207ENST00000573051 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PNPLA1-202ENST00000388715 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 IGLV1-41-201ENST00000519790 406 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-54-201ENST00000622166 353 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ZFYVE1-201ENST00000318876 4362 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ZNF879-201ENST00000444149 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ZNF80-203ENST00000619534 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 PUS3-201ENST00000227474 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 FMN1-207ENST00000559047 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN23-201ENST00000289788 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 USP32P1-201ENST00000341745 3233 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 ATP8A2-201ENST00000255283 3287 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 SLC38A7-206ENST00000564100 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AKAP13-217ENST00000560302 3765 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SGIP1Q9BQI5 AC134508.1-201ENST00000570082 2977 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms