Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
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KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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KRTAP21-1Q3LI58 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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KRTAP21-1Q3LI58 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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KRTAP21-1Q3LI58 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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KRTAP21-1Q3LI58 LIPF-202ENST00000355843 1357 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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KRTAP21-1Q3LI58 DYNLT3-202ENST00000378581 920 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCA2-205ENST00000382183 1178 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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