Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC142Q17RM4 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC142Q17RM4 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC142Q17RM4 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC142Q17RM4 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC142Q17RM4 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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