RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CCL20-202ENST00000409189 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.52■■■□□ 2.32
CCL20-202ENST00000409189 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CCL20-202ENST00000409189 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CCL20-202ENST00000409189 POTEDQ86YR6 584 aa25.35■■□□□ 1.65
CCL20-202ENST00000409189 FOXD1Q16676 465 aa25.24■■□□□ 1.63
CCL20-202ENST00000409189 MSH5O43196 834 aa24.28■■□□□ 1.48
CCL20-202ENST00000409189 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.64■■□□□ 1.37
CCL20-202ENST00000409189 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CCL20-202ENST00000409189 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.05■■□□□ 1.28
CCL20-202ENST00000409189 ADRA2BP18089 450 aa22.94■■□□□ 1.26
CCL20-202ENST00000409189 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CCL20-202ENST00000409189 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.29■■□□□ 1
CCL20-202ENST00000409189 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCL20-202ENST00000409189 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CCL20-202ENST00000409189 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.73■□□□□ 0.91
CCL20-202ENST00000409189 RNF39Q9H2S5 420 aa20.49■□□□□ 0.87
CCL20-202ENST00000409189 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.43■□□□□ 0.86
CCL20-202ENST00000409189 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.32■□□□□ 0.84
CCL20-202ENST00000409189 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCL20-202ENST00000409189 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCL20-202ENST00000409189 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCL20-202ENST00000409189 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.77■□□□□ 0.76
CCL20-202ENST00000409189 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCL20-202ENST00000409189 POTEHQ6S545 545 aa19.71■□□□□ 0.75
CCL20-202ENST00000409189 KCNA4P22459 653 aa19.47■□□□□ 0.71
CCL20-202ENST00000409189 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.66
CCL20-202ENST00000409189 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
CCL20-202ENST00000409189 SLC4A2P04920 1241 aa18.81■□□□□ 0.6
CCL20-202ENST00000409189 DSG3P32926 999 aa18.79■□□□□ 0.6
CCL20-202ENST00000409189 CAPN15O75808 1086 aa18.67■□□□□ 0.58
CCL20-202ENST00000409189 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CCL20-202ENST00000409189 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCL20-202ENST00000409189 APLP2Q06481 763 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL20-202ENST00000409189 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CCL20-202ENST00000409189 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CCL20-202ENST00000409189 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CCL20-202ENST00000409189 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCL20-202ENST00000409189 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CCL20-202ENST00000409189 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.13■□□□□ 0.49
CCL20-202ENST00000409189 ABCB7O75027 752 aa18.05■□□□□ 0.48
CCL20-202ENST00000409189 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.05■□□□□ 0.48
CCL20-202ENST00000409189 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB22O15209 634 aa17.94■□□□□ 0.46
CCL20-202ENST00000409189 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CCL20-202ENST00000409189 POLA2Q14181 598 aa17.74■□□□□ 0.43
CCL20-202ENST00000409189 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.6■□□□□ 0.41
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CCL20-202ENST00000409189 AKT1S1Q96B36 256 aa17.42■□□□□ 0.38
CCL20-202ENST00000409189 HAX1O00165 279 aa17.35■□□□□ 0.37
CCL20-202ENST00000409189 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.32■□□□□ 0.36
CCL20-202ENST00000409189 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.25■□□□□ 0.35
CCL20-202ENST00000409189 OSCARQ8IYS5 282 aa17.19■□□□□ 0.34
CCL20-202ENST00000409189 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCL20-202ENST00000409189 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
CCL20-202ENST00000409189 FBLN2P98095 1184 aa17.03■□□□□ 0.32
CCL20-202ENST00000409189 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CCL20-202ENST00000409189 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.01■□□□□ 0.31
CCL20-202ENST00000409189 PITPNM1O00562 1244 aa16.98■□□□□ 0.31
CCL20-202ENST00000409189 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.92■□□□□ 0.3
CCL20-202ENST00000409189 SPDYE6P0CI01 402 aa16.92■□□□□ 0.3
CCL20-202ENST00000409189 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.92■□□□□ 0.3
CCL20-202ENST00000409189 EVX2Q03828 476 aa16.86■□□□□ 0.29
CCL20-202ENST00000409189 LHX8Q68G74 356 aa16.83■□□□□ 0.28
CCL20-202ENST00000409189 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.76■□□□□ 0.27
CCL20-202ENST00000409189 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CCL20-202ENST00000409189 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.65■□□□□ 0.26
CCL20-202ENST00000409189 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.58■□□□□ 0.24
CCL20-202ENST00000409189 GABBR2O75899 941 aa16.57■□□□□ 0.24
CCL20-202ENST00000409189 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CCL20-202ENST00000409189 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CCL20-202ENST00000409189 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
CCL20-202ENST00000409189 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.44■□□□□ 0.22
CCL20-202ENST00000409189 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.23■□□□□ 0.19
CCL20-202ENST00000409189 PRR29P0C7W0 189 aa16.23■□□□□ 0.19
CCL20-202ENST00000409189 CLCN6P51797 869 aa16.23■□□□□ 0.19
CCL20-202ENST00000409189 CHADLQ6NUI6 762 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL20-202ENST00000409189 POTEIP0CG38 1075 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL20-202ENST00000409189 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.06■□□□□ 0.16
CCL20-202ENST00000409189 PROM2Q8N271 834 aa16■□□□□ 0.15
CCL20-202ENST00000409189 DCBLD2Q96PD2 775 aa16■□□□□ 0.15
CCL20-202ENST00000409189 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCL20-202ENST00000409189 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CCL20-202ENST00000409189 CREBZFQ9NS37 354 aa15.93■□□□□ 0.14
CCL20-202ENST00000409189 POTEMA6NI47 508 aa15.91■□□□□ 0.14
CCL20-202ENST00000409189 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.89■□□□□ 0.13
CCL20-202ENST00000409189 POTEGQ6S5H5 508 aa15.81■□□□□ 0.12
CCL20-202ENST00000409189 OTUD5Q96G74 571 aa15.78■□□□□ 0.12
CCL20-202ENST00000409189 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CCL20-202ENST00000409189 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CCL20-202ENST00000409189 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
CCL20-202ENST00000409189 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.59■□□□□ 0.09
CCL20-202ENST00000409189 FKBP8Q14318 412 aa15.57■□□□□ 0.08
CCL20-202ENST00000409189 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.54■□□□□ 0.08
CCL20-202ENST00000409189 POTEB2H3BUK9 544 aa15.53■□□□□ 0.08
CCL20-202ENST00000409189 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCL20-202ENST00000409189 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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