RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CCL20-202ENST00000409189 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.52■■■□□ 2.32
CCL20-202ENST00000409189 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CCL20-202ENST00000409189 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CCL20-202ENST00000409189 POTEDQ86YR6 584 aa25.35■■□□□ 1.65
CCL20-202ENST00000409189 FOXD1Q16676 465 aa25.24■■□□□ 1.63
CCL20-202ENST00000409189 MSH5O43196 834 aa24.28■■□□□ 1.48
CCL20-202ENST00000409189 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.64■■□□□ 1.37
CCL20-202ENST00000409189 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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CCL20-202ENST00000409189 ADRA2BP18089 450 aa22.94■■□□□ 1.26
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CCL20-202ENST00000409189 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.29■■□□□ 1
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CCL20-202ENST00000409189 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.73■□□□□ 0.91
CCL20-202ENST00000409189 RNF39Q9H2S5 420 aa20.49■□□□□ 0.87
CCL20-202ENST00000409189 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.43■□□□□ 0.86
CCL20-202ENST00000409189 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.32■□□□□ 0.84
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CCL20-202ENST00000409189 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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CCL20-202ENST00000409189 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCL20-202ENST00000409189 POTEHQ6S545 545 aa19.71■□□□□ 0.75
CCL20-202ENST00000409189 KCNA4P22459 653 aa19.47■□□□□ 0.71
CCL20-202ENST00000409189 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.66
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CCL20-202ENST00000409189 CAPN15O75808 1086 aa18.67■□□□□ 0.58
CCL20-202ENST00000409189 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CCL20-202ENST00000409189 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
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CCL20-202ENST00000409189 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCL20-202ENST00000409189 APLP2Q06481 763 aa18.32■□□□□ 0.52
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CCL20-202ENST00000409189 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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CCL20-202ENST00000409189 ABCB7O75027 752 aa18.05■□□□□ 0.48
CCL20-202ENST00000409189 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.05■□□□□ 0.48
CCL20-202ENST00000409189 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB22O15209 634 aa17.94■□□□□ 0.46
CCL20-202ENST00000409189 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CCL20-202ENST00000409189 POLA2Q14181 598 aa17.74■□□□□ 0.43
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CCL20-202ENST00000409189 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CCL20-202ENST00000409189 AKT1S1Q96B36 256 aa17.42■□□□□ 0.38
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CCL20-202ENST00000409189 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.32■□□□□ 0.36
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CCL20-202ENST00000409189 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
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CCL20-202ENST00000409189 FBLN2P98095 1184 aa17.03■□□□□ 0.32
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CCL20-202ENST00000409189 SPDYE6P0CI01 402 aa16.92■□□□□ 0.3
CCL20-202ENST00000409189 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.92■□□□□ 0.3
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CCL20-202ENST00000409189 LHX8Q68G74 356 aa16.83■□□□□ 0.28
CCL20-202ENST00000409189 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.76■□□□□ 0.27
CCL20-202ENST00000409189 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CCL20-202ENST00000409189 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.65■□□□□ 0.26
CCL20-202ENST00000409189 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.58■□□□□ 0.24
CCL20-202ENST00000409189 GABBR2O75899 941 aa16.57■□□□□ 0.24
CCL20-202ENST00000409189 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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CCL20-202ENST00000409189 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.23■□□□□ 0.19
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CCL20-202ENST00000409189 PROM2Q8N271 834 aa16■□□□□ 0.15
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CCL20-202ENST00000409189 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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CCL20-202ENST00000409189 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CCL20-202ENST00000409189 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CCL20-202ENST00000409189 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
CCL20-202ENST00000409189 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.59■□□□□ 0.09
CCL20-202ENST00000409189 FKBP8Q14318 412 aa15.57■□□□□ 0.08
CCL20-202ENST00000409189 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.54■□□□□ 0.08
CCL20-202ENST00000409189 POTEB2H3BUK9 544 aa15.53■□□□□ 0.08
CCL20-202ENST00000409189 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCL20-202ENST00000409189 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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