Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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