Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APAF1O14727 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
APAF1O14727 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
APAF1O14727 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms