Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7AP4-201ENST00000483820 769 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010307.2-201ENST00000509051 466 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023511.1-201ENST00000549055 571 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010760.1-201ENST00000565129 545 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SHBG-218ENST00000576728 776 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139351.1-201ENST00000622092 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005691.1-201ENST00000624723 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135068.7-201ENST00000630145 568 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC132825.5-201ENST00000640603 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-312ENST00000641391 2488 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-378ENST00000642009 2463 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092329.4-202ENST00000638174 1989 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL8-201ENST00000358855 4422 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN9-203ENST00000366666 2173 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 USP32P1-201ENST00000341745 3233 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ABRAXAS1-201ENST00000321945 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP5-AS1-201ENST00000367477 2927 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000977.1-201ENST00000501964 2908 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms