Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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GAPVD1Q14C86 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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GAPVD1Q14C86 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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GAPVD1Q14C86 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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GAPVD1Q14C86 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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GAPVD1Q14C86 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
GAPVD1Q14C86 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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