Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
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