Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RUNX1T1-248ENST00000613302 7687 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms