Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 BCOR-204ENST00000378463 2230 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ADGRE2-204ENST00000392965 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PIPSL-202ENST00000489875 2733 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01163-202ENST00000630252 3086 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 C8orf46-201ENST00000305454 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SPIB-205ENST00000595883 3791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FAM131B-201ENST00000409222 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NUTM1-202ENST00000438749 3922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RGL1-201ENST00000304685 5100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TNC-201ENST00000341037 6786 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 EIF2S1-201ENST00000256383 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CSF2RB-201ENST00000262825 4087 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF135-203ENST00000401053 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FLRT2-204ENST00000554746 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SERINC1-201ENST00000339697 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 INSC-203ENST00000424273 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ARHGAP25-207ENST00000467265 2247 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ATP2B3-203ENST00000359149 4234 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MAGEB17-201ENST00000400003 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TTTY6-201ENST00000253838 491 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TTTY6B-201ENST00000253848 491 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CCL27-201ENST00000259631 446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LCN1-201ENST00000263598 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR5689HG-201ENST00000366312 656 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 GCG-201ENST00000375497 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR711-201ENST00000390201 76 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CD160-203ENST00000401557 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL512306.3-201ENST00000453895 683 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01863-201ENST00000523242 494 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC098965.1-201ENST00000564217 967 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01177-201ENST00000568030 536 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC018761.3-201ENST00000590065 388 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC011467.5-201ENST00000597392 996 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL122127.1-201ENST00000603832 327 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC015660.4-201ENST00000621331 621 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 EPB41L1-218ENST00000628415 3287 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MPO-201ENST00000225275 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SPDYE3-201ENST00000332397 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CLDN2-202ENST00000540876 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PAX6-282ENST00000640975 2553 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL035681.1-201ENST00000441316 2500 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CES5A-206ENST00000521992 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 DNASE1L3-206ENST00000483681 2099 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RSPH3-203ENST00000449822 1904 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RSPH10B2-203ENST00000404077 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RSPH10B-202ENST00000404406 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LMOD1-202ENST00000616739 3058 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TRPM1-201ENST00000256552 5514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 HAVCR1-206ENST00000625904 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CYP4A11-202ENST00000371904 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LIPG-202ENST00000427224 1760 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CYP4A22-207ENST00000620131 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC026333.3-201ENST00000543611 1731 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 BTN2A1-204ENST00000469185 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CD22-202ENST00000341773 2755 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NOP2-223ENST00000620535 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 GFM1-210ENST00000486715 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AMT-236ENST00000636597 1509 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC138869.3-201ENST00000563960 2486 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNRD1ASP-212ENST00000420251 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ACVR2A-202ENST00000404590 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PGM2-201ENST00000381967 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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