Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AP000445.1-201ENST00000526692 741 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC009779.4-201ENST00000554248 611 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BCL11BQ9C0K0 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 LRTOMT-203ENST00000324866 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC008522.1-201ENST00000639479 2906 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC024610.2-205ENST00000584758 1567 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 MTIF3-202ENST00000381120 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms