Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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