Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms