Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYVE1Q9Y5Y7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms