Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2Q9Y4W6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms