Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HCC1Q9Y3T6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms