Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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