Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms