Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms