Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms