Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms