Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms