Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXL4Q9UKA2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXL4Q9UKA2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms