Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms