Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms