Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP25Q9UHP3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms