Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms