Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms