Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms