Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN3Q9P232 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms