Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms