Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms