Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms