Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF3Q9NUQ8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms