Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms