Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms