Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms